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AI モデルにより加齢造血幹細胞の「司令塔」Pbx1 を発見
―赤血球産生の低下と血小板への偏りを生む遺伝子ネットワークを解明―

2026年8月25日
国立大学法人東北大学
国立健康危機管理研究機構

発表者

田久保 圭誉(国立健康危機管理研究機構 国立国際医療研究所 造血システム研究部長)

発表のポイント


概要

造血幹細胞は、生涯にわたって赤血球、白血球、血小板などを産生する長寿命の細胞です。加齢するとその数は増加しますが、血液を再構築する能力は低下し、赤血球やリンパ球の産生が減少する一方、血小板や骨髄球系細胞を産生しやすくなりますが、その制御因子は明らかになっていませんでした。

東北大学大学院医学系研究科幹細胞医学分野と国立健康危機管理研究機構国立国際医療研究所造血システム研究部の研究グループは、若齢および加齢マウスの造血幹細胞について、単一細胞RNAシーケンス(注6、AI解析、遺伝子発現・エピゲノム解析および移植実験を組み合わせて解析しました。その結果、加齢造血幹細胞は、未分化性質と、巨核球(注7・血小板系への分化しやすさを同時に備えていることがわかりました。さらに、Geneformerを若齢・加齢造血細胞で追加学習し、AI解析と転写制御因子のスクリーニングを組み合わせることで、Pbx1を加齢造血幹細胞のネットワークの中心因子として同定しました。Pbx1は赤血球分化に必要なGata1の誘導を抑制することで赤血球産生を低下させ、相対的に血小板産生への偏りを引き起こすことが示されました。

本成果は、2026年8月22日に学術誌「Science Advances」に掲載されました。

用語説明

(注1)造血幹細胞:哺乳類の成体では主に骨髄に存在する希少な細胞です。自らと同じ細胞を作る自己複製能と、赤血球、白血球、血小板など全ての血液細胞へ分化する能力を持ち、生涯にわたる血液産生を支えます。

(注2)Geneformer:単一細胞RNAシーケンスデータを学習するTransformer型のAI基盤モデルです。各細胞で発現する遺伝子を文章中の単語のように扱い、細胞状態に応じた遺伝子同士の関係を学習します。本研究で用いたモデルは、約3,000万細胞のデータで事前学習されています。

(注3)遺伝子制御ネットワーク:転写因子などの制御因子と、それらの影響を受ける遺伝子との関係をネットワークとして表したものです。多数の遺伝子や機能群をつなぐ中心的な因子を「ハブ」と呼びます。

(注4)Pbx1:DNAに結合して遺伝子発現を調節する転写因子の一つです。HOXやMEISと呼ばれるタンパク質と協調し、発生、細胞分化、造血幹細胞の静止状態や自己複製などを制御します。

(注5)Gata1:赤血球および巨核球・血小板系への分化に重要な転写因子です。造血幹・前駆細胞が赤血球へ分化する際には、Gata1が適切な時期に誘導される必要があります。




詳細は以下のファイルをご覧ください。
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